IMAP -protokollaa käyttäessä sähköpostiviestit säilyvät palvelimella, ja samaa sähköpostia voi sen ansiosta käyttää useilta eri laitteilta.
POP3 -protokolla kopioi ensin kaikki viestit palvelimelta sille laitteelle, josta yhteys on otettu. Samalla viestit poistetaan palvelimelta (ellei toisin määrätä). POP3 -protokollan käyttö ei ole suositeltavaa mikäli samaa sähköpostia halutaan käyttää useammalta laitteelta, esim. tietokoneelta ja mobiililaitteelta.